Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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