Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LYVE1Q9Y5Y7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms