Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB23Q9ULC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB23Q9ULC3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB23Q9ULC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms