Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.76■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT172Q9UG01 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT172Q9UG01 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms