Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFDP1Q9UEE9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFDP1Q9UEE9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFDP1Q9UEE9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms