Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPAS39Q9H9C1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms