Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1EQ9GZS1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1EQ9GZS1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms