Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIFKQ9BYG3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIFKQ9BYG3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIFKQ9BYG3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms