Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CITED2Q99967 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CITED2Q99967 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms