Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPOR3Q96MK2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPOR3Q96MK2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms