Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf48Q96LL4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms