Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD3Q96L08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD3Q96L08 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD3Q96L08 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms