Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM12Q96EX1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms