Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRRFQ96E11 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRRFQ96E11 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms