Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LINC00116Q8NCU8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LINC00116Q8NCU8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LINC00116Q8NCU8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LINC00116Q8NCU8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LINC00116Q8NCU8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LINC00116Q8NCU8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
LINC00116Q8NCU8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LINC00116Q8NCU8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LINC00116Q8NCU8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LINC00116Q8NCU8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms