Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PNLDC1Q8NA58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms