Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms