Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD4L3Q6VB84 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms