Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD2Q6P5Q4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD2Q6P5Q4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms