Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WSCD1Q658N2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
WSCD1Q658N2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WSCD1Q658N2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms