Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMTC4Q5T4D3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMTC4Q5T4D3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms