Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC93Q567U6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC93Q567U6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms