Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC27Q2M243 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC27Q2M243 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms