Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKG1Q13976 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKG1Q13976 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKG1Q13976 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKG1Q13976 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKG1Q13976 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKG1Q13976 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKG1Q13976 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKG1Q13976 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKG1Q13976 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms