Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF9Q13886 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms