Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 LEU5YHR002W 1074 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 PFA4YOL003C 1137 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 GLN1YPR035W 1113 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 TEP1YNL128W 1305 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 UTP9YHR196W 1728 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 PXL1YKR090W 2121 nt6.92□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 ATG4YNL223W 1485 nt6.92□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.92□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 SFT2YBL102W 648 nt6.92□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 MNS1YJR131W 1650 nt6.92□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 VPS36YLR417W 1701 nt6.92□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 PRI2YKL045W 1587 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 LDB19YOR322C 2457 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 COX20YDR231C 618 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 SAY1YGR263C 1275 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YHL045WYHL045W 348 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 CTR2YHR175W 570 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 MHO1YJR008W 1017 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YLR126CYLR126C 756 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 CKS1YBR135W 453 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 MRPS5YBR251W 924 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 TPO3YPR156C 1869 nt6.91□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 GPI11YDR302W 660 nt6.9□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 PHB1YGR132C 864 nt6.9□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.9□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt6.9□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 NUP1YOR098C 3231 nt6.9□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 PCS60YBR222C 1632 nt6.9□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 ERG26YGL001C 1050 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 DUO1YGL061C 744 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 YPL102CYPL102C 303 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 GPA2YER020W 1350 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 ORC5YNL261W 1440 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 MAD3YJL013C 1548 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 ATR1YML116W 1629 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 LCB2YDR062W 1686 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 ICL2YPR006C 1728 nt6.89□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 MRE11YMR224C 2079 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 FAA4YMR246W 2085 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 HXT7YDR342C 1713 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 HXT6YDR343C 1713 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 DFM1YDR411C 1026 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 YLF2YHL014C 1218 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 YKL031WYKL031W 414 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 TOM40YMR203W 1164 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 NOP13YNL175C 1212 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 SUI3YPL237W 858 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 IFA38YBR159W 1044 nt6.88□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 MCM3YEL032W 2916 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 AFG1YEL052W 1530 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 RPT1YKL145W 1404 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 UGX2YDL169C 672 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 PRS2YER099C 957 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 MAC1YMR021C 1254 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 YNL143CYNL143C 393 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 ARG8YOL140W 1272 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 YOL163WYOL163W 510 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 VPS28YPL065W 729 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 GEX2YKR106W 1848 nt6.87□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 FRS2YFL022C 1512 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 SSK1YLR006C 2139 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 PGK1YCR012W 1251 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 RMD1YDL001W 1293 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 INO2YDR123C 915 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 FPR2YDR519W 408 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 SEN34YAR008W 828 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 YOR200WYOR200W 399 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 PEX32YBR168W 1242 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 IML2YJL082W 2196 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 SET5YHR207C 1581 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 RSP5YER125W 2430 nt6.86□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 QRI1YDL103C 1434 nt6.85□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 HOS1YPR068C 1413 nt6.85□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 GPT2YKR067W 2232 nt6.85□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 ERC1YHR032W 1746 nt6.85□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 UBC6YER100W 753 nt6.85□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 YGL262WYGL262W 528 nt6.85□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 COR1YBL045C 1374 nt6.84□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 APN1YKL114C 1104 nt6.84□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 ADD37YMR184W 597 nt6.84□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 NPT1YOR209C 1290 nt6.84□□□□□ -1.31
SSF2Q12153 DUG1YFR044C 1446 nt6.84□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 CLN1YMR199W 1641 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 MNN5YJL186W 1761 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 DBP9YLR276C 1785 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 YLR311CYLR311C 348 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 SHP1YBL058W 1272 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 UBC11YOR339C 471 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 AME1YBR211C 975 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 SET4YJL105W 1683 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 OMS1YDR316W 1416 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 GUP2YPL189W 1830 nt6.83□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 YHL017WYHL017W 1599 nt6.82□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 PDR18YNR070W 4002 nt6.82□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 FKH1YIL131C 1455 nt6.82□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 SCL1YGL011C 759 nt6.82□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 FMP48YGR052W 1110 nt6.82□□□□□ -1.32
SSF2Q12153 YGR273CYGR273C 525 nt6.82□□□□□ -1.32
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