Protein–RNA interactions for Protein: Q00723

PRP38, Pre-mRNA-splicing factor 38, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP38Q00723 RFA1YAR007C 1866 nt5.37□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 MTQ2YDR140W 666 nt5.36□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YKL031WYKL031W 414 nt5.36□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 MTQ1YNL063W 945 nt5.36□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YNL108CYNL108C 813 nt5.36□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 UGO1YDR470C 1509 nt5.36□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 UTP7YER082C 1665 nt5.36□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YDR396WYDR396W 501 nt5.35□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YGR022CYGR022C 330 nt5.35□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 RPR2YIR015W 435 nt5.35□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 COX17YLL009C 210 nt5.35□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 SSP120YLR250W 705 nt5.35□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YBL044WYBL044W 369 nt5.35□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 UTP9YHR196W 1728 nt5.34□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 SNT2YGL131C 4212 nt5.34□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YDR053WYDR053W 396 nt5.34□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 CDC43YGL155W 1131 nt5.34□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 MPM1YJL066C 759 nt5.34□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 RHO4YKR055W 876 nt5.34□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 PGA3YML125C 939 nt5.34□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 NOP2YNL061W 1857 nt5.34□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 HXT3YDR345C 1704 nt5.34□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 VBA1YMR088C 1689 nt5.34□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 CCZ1YBR131W 2115 nt5.33□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 ACF2YLR144C 2340 nt5.33□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YDR154CYDR154C 351 nt5.33□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 GLO2YDR272W 825 nt5.33□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 AVO1YOL078W 3531 nt5.33□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 SHE10YGL228W 1734 nt5.32□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 RHB1YCR027C 630 nt5.32□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 ATG17YLR423C 1254 nt5.32□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YNR048WYNR048W 1182 nt5.32□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.32□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 HFI1YPL254W 1467 nt5.32□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 FOB1YDR110W 1701 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 SIT1YEL065W 1887 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 CWC21YDR482C 408 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 NCS6YGL211W 1080 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YPR195CYPR195C 330 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 DEF1YKL054C 2217 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 SMF3YLR034C 1422 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YDR541CYDR541C 1035 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 LCP5YER127W 1074 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 BNS1YGR230W 414 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 MRPL36YBR122C 534 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 SSZ1YHR064C 1617 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YMR155WYMR155W 1644 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 SEC18YBR080C 2277 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 PDC1YLR044C 1692 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 NQM1YGR043C 1002 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YGR176WYGR176W 348 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 VMA16YHR026W 642 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 MRP17YKL003C 396 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 APN1YKL114C 1104 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 PIN2YOR104W 849 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 UBC4YBR082C 447 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 HOS1YPR068C 1413 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 RAT1YOR048C 3021 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 ELP3YPL086C 1674 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 HRP1YOL123W 1605 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 VAM7YGL212W 951 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YKR041WYKR041W 753 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 HST2YPL015C 1074 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 PDB1YBR221C 1101 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 YMR027WYMR027W 1413 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 DED81YHR019C 1665 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP38Q00723 ECM3YOR092W 1842 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 YAP1801YHR161C 1914 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 GIR2YDR152W 798 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 YEL077CYEL077C 3834 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 RPT1YKL145W 1404 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 LST8YNL006W 912 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 FOL1YNL256W 2475 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 SUE1YPR151C 621 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 ARR3YPR201W 1215 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 HSP104YLL026W 2727 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 RBA50YDR527W 1320 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 RPT4YOR259C 1314 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 VPS1YKR001C 2115 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 AI5_BETAQ0075 1065 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 RHO3YIL118W 696 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 MND2YIR025W 1107 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 SEC17YBL050W 879 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 GEP3YOR205C 1671 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 VTC2YFL004W 2487 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 COX26YDR119W-A 201 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.4 ms