Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBX1P67809 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBX1P67809 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
YBX1P67809 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBX1P67809 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBX1P67809 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBX1P67809 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBX1P67809 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBX1P67809 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBX1P67809 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBX1P67809 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBX1P67809 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YBX1P67809 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YBX1P67809 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YBX1P67809 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YBX1P67809 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBX1P67809 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBX1P67809 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBX1P67809 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBX1P67809 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBX1P67809 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBX1P67809 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBX1P67809 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBX1P67809 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBX1P67809 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YBX1P67809 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBX1P67809 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBX1P67809 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YBX1P67809 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX1P67809 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX1P67809 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX1P67809 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX1P67809 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX1P67809 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX1P67809 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX1P67809 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YBX1P67809 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YBX1P67809 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YBX1P67809 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX1P67809 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX1P67809 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX1P67809 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YBX1P67809 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX1P67809 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX1P67809 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX1P67809 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX1P67809 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX1P67809 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX1P67809 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX1P67809 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YBX1P67809 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX1P67809 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX1P67809 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX1P67809 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX1P67809 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX1P67809 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX1P67809 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX1P67809 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YBX1P67809 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms