Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFM1P61960 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFM1P61960 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFM1P61960 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFM1P61960 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFM1P61960 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFM1P61960 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UFM1P61960 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFM1P61960 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFM1P61960 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFM1P61960 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFM1P61960 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFM1P61960 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFM1P61960 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UFM1P61960 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFM1P61960 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFM1P61960 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFM1P61960 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFM1P61960 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFM1P61960 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFM1P61960 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFM1P61960 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFM1P61960 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFM1P61960 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UFM1P61960 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFM1P61960 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFM1P61960 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFM1P61960 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFM1P61960 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFM1P61960 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFM1P61960 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UFM1P61960 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UFM1P61960 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFM1P61960 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFM1P61960 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFM1P61960 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFM1P61960 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFM1P61960 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFM1P61960 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFM1P61960 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFM1P61960 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFM1P61960 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFM1P61960 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFM1P61960 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFM1P61960 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms