Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP7P55210 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP7P55210 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASP7P55210 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASP7P55210 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASP7P55210 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASP7P55210 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASP7P55210 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASP7P55210 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASP7P55210 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASP7P55210 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP7P55210 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP7P55210 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP7P55210 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP7P55210 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP7P55210 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP7P55210 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP7P55210 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP7P55210 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP7P55210 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASP7P55210 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASP7P55210 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASP7P55210 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASP7P55210 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASP7P55210 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASP7P55210 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASP7P55210 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASP7P55210 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASP7P55210 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP7P55210 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP7P55210 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP7P55210 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP7P55210 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP7P55210 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP7P55210 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP7P55210 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP7P55210 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP7P55210 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP7P55210 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP7P55210 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CASP7P55210 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP7P55210 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP7P55210 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP7P55210 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP7P55210 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP7P55210 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP7P55210 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP7P55210 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP7P55210 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP7P55210 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP7P55210 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP7P55210 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP7P55210 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP7P55210 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP7P55210 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP7P55210 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP7P55210 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP7P55210 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP7P55210 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP7P55210 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP7P55210 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP7P55210 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP7P55210 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP7P55210 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP7P55210 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP7P55210 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP7P55210 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP7P55210 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP7P55210 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP7P55210 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP7P55210 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP7P55210 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP7P55210 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms