Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN7P41732 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN7P41732 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms