Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VHLP40337 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VHLP40337 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VHLP40337 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VHLP40337 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VHLP40337 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VHLP40337 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VHLP40337 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VHLP40337 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VHLP40337 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VHLP40337 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VHLP40337 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VHLP40337 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VHLP40337 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VHLP40337 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VHLP40337 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VHLP40337 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VHLP40337 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VHLP40337 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VHLP40337 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VHLP40337 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VHLP40337 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VHLP40337 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VHLP40337 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VHLP40337 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VHLP40337 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VHLP40337 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VHLP40337 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VHLP40337 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VHLP40337 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VHLP40337 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VHLP40337 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VHLP40337 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VHLP40337 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VHLP40337 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VHLP40337 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VHLP40337 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VHLP40337 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VHLP40337 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VHLP40337 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VHLP40337 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VHLP40337 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VHLP40337 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VHLP40337 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VHLP40337 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VHLP40337 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VHLP40337 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLP40337 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLP40337 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLP40337 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLP40337 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLP40337 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLP40337 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLP40337 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLP40337 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLP40337 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLP40337 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLP40337 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLP40337 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms