Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5AP29375 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM5AP29375 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5AP29375 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms