Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIN3BO75182 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms