Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM4AO75164 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms