Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms