Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP46A1Q9Y6A2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP46A1Q9Y6A2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms