Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LEMD3Q9Y2U8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LEMD3Q9Y2U8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LEMD3Q9Y2U8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms