Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
AKAP11Q9UKA4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AKAP11Q9UKA4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms