Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMSN1Q9NSI8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms