Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF19Q9NS68 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.5 ms