Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUDS3Q9H7L9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUDS3Q9H7L9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms