Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLSTN2Q9H4D0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN2Q9H4D0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN2Q9H4D0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms