Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms