Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GFRA4Q9GZZ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GFRA4Q9GZZ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms