Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VN1R3Q9BXE9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VN1R3Q9BXE9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VN1R3Q9BXE9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms