Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms