Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D3AQ9BRG2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH2D3AQ9BRG2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.3 ms