Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOX2Q8IUF8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOX2Q8IUF8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RIOX2Q8IUF8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms