Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SKAP1Q86WV1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SKAP1Q86WV1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SKAP1Q86WV1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms